香港開源年會每年都由專注於開放原碼發展的社群組織聯合主辦：
開源香港
開源香港 ( Open Source Hong Kong，簡稱 OSHK ) 成立於 2006 年，支持開放源碼開發者、貢獻者、程序員、愛好者及用家持續發展及交流，每年在香港及亞洲舉辦及支持多項大型會議及活動，包括香港開源年會、台灣開源人年會、Open Data Day、PyCon HK 年會等，鼓勵協作發展並擁抱世界各地開源社群。
香港創意開放科技協會
香港開放創意科技協會 ( Hong Kong Creative Open Technology Association，簡稱 HKCOTA )，成立於 2014 年，是香港政府認可的非牟利教育慈善團體 ( Reg.# 91/13580 )。成立目的，為向學生及在職人士，教育及推廣開放標準，自由及開放軟體，開放硬體，開放資料及共享創意。
香港 Linux 用家協會
香港Linux用家協會 ( Hong Kong Linux User Group，簡稱 HKLUG ) 是一個由香港 GNU/Linux 及自由或開源軟體 ( F/OSS ) 愛好者組成的非牟利組織，旨在聚集香港各 GNU/Linux 及 F/OSS 用家及開發者，提供機會互相交流 GNU/Linux 及 F/OSS 上的經驗，協助各新手，推廣 GNU/Linux 及 F/OSS 在香港的應用，以及充當香港 F/OSS 用戶和開發者，與世界各地 F/OSS 用家、開發者及組織的溝通橋樑，以助整個 GNU/Linux 與及 F/OSS 界的發展。HKLUG 為香港註冊社團編號 21299。